إثر اعلان نتيجة امتحانات الثانوية العامة بدأ طلاب الثانوية العامة مرحلة جديدة وهي مرحلة تنسيق الجامعات حيث صرح مصدر في وزارة التربية والتعليم ان المرحلة الأولي من تنسيق الثانوية العامة 2016 سوف تبدأ يوم الخميس القادم، حيث يبدأ استقبال رغبات الطلاب الناجحين في امتحانات الثانوية العامة علي موقع مكتب التنسيق بعد قيام الطلاب بسحب ملفاتهم من المدارس، ويقوم المجلس الأعلى للجامعات بالإشراف علي تنسيق الثانوية العامة ويحدد الحد الأدنى للقبول في الكليات والمعاهد الحكومية والخاصة .
وقد ذكر رئيس قطاع التعليم والمشرف العام علي مكتب التنسيق انه سوف يتم تشعيل خدمة التنسيق في معامل الحاسبات في الجامعات المصرية اثناء المدة المحددة لعملية تنسيق الثانوية العامة او دخول الطلاب علي بوابة الحكومة المصرية الالكترونية والدخول لموقع التنسيق، و قد تقرر ايضاً ان يتم فتح معامل جامعات مصر اثناء ايام المرحلة الأولي من التنسيق اعتباراً من الساعة التاسعة صباحاً وحتي الساعة الخامسة مساءاً، وايضاً سوف يكون التنسيق متاحاً طوال اليوم علي موقع التنسيق خلال ايام المرحلة الأولي حيث يمكن للطلاب الدخول لموقع التنسيق من الحاسب الشخصي الخاص به .
ومؤشرات تنسيق الثانوية العامة هذا العام توضح انه قد لا يكون هناك اختلاف كبير بين تنسيق الثانوية العامة في هذا العام عن العام الماضي، فمن المتوقع ان يكون الحد الأدنى لقبول الطلاب في كلية الطب البشري مجموع 98.4 %، وكلية الأسنان مجموع 97.95 %، و ايضاً كلية الصيدلة مجموع 97 %، اما كلية الهندسة فمن المتوقع ان يكون الحد الأدنى لقبول الطلاب بها هو مجموع 93.2 %، ونسبة الحد الأدنى للقبول في الجامعات الادبية في تنسيق هذا العام يتوقع حدوث ارتفاع في هذه النسبة هذا العام عن العام الماضي، اما شعبة علمي رياضة فمن المتوقع ان تشهد تراجع بسيط عن العام الماضي بسبب زيادة نسبة الرسوب، بعكس تنسيق شعبة علمي علوم فمن المتوقع ان تكون نسبتها أقرب الي تنسيق العام الماضي ولم تشهد أي تغيير ملحوظ هذا العام .